Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms