Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf148G3X9R7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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Rnf148G3X9R7 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Rnf148G3X9R7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Rnf148G3X9R7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf148G3X9R7 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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