Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Usp9yF8VPU6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms