Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa35E9QLQ1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms