Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm11191-201ENSMUST00000117231 610 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gcn1E9PVA8 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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