Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5478D3Z6R0 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5478D3Z6R0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms