Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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BC048679D3YXE9 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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BC048679D3YXE9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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BC048679D3YXE9 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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BC048679D3YXE9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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BC048679D3YXE9 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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BC048679D3YXE9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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BC048679D3YXE9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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BC048679D3YXE9 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC048679D3YXE9 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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