Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmf1B9EKI3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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