Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrt4B2RU40 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms