Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rrn3B2RS91 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms