Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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