Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Skint4A7TZF3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms