Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F6

Ttll13, Tubulin polyglutamylase TTLL13, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll13A4Q9F6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttll13A4Q9F6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms