Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scn3aA2ASI5 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Scn3aA2ASI5 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Scn3aA2ASI5 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Scn3aA2ASI5 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Scn3aA2ASI5 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Scn3aA2ASI5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Scn3aA2ASI5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Scn3aA2ASI5 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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