Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Fam43bA2AM80 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Fam43bA2AM80 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Fam43bA2AM80 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Fam43bA2AM80 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Fam43bA2AM80 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Fam43bA2AM80 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Fam43bA2AM80 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fam43bA2AM80 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam43bA2AM80 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms