Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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