Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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