Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl8Q9Z121 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl8Q9Z121 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms