Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn13Q9Z0S4 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms