Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trpc2Q9R244 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trpc2Q9R244 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trpc2Q9R244 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trpc2Q9R244 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trpc2Q9R244 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trpc2Q9R244 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trpc2Q9R244 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trpc2Q9R244 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trpc2Q9R244 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trpc2Q9R244 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trpc2Q9R244 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trpc2Q9R244 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trpc2Q9R244 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trpc2Q9R244 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Trpc2Q9R244 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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