Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ercc4Q9QZD4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ercc4Q9QZD4 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ercc4Q9QZD4 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ercc4Q9QZD4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ercc4Q9QZD4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Ercc4Q9QZD4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ercc4Q9QZD4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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