Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nphp1Q9QY53 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nphp1Q9QY53 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms