Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms