Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Csnk1eQ9JMK2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms