Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cabp1Q9JLK7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms