Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cabp2Q9JLK4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp2Q9JLK4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms