Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tgm1Q9JLF6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgm1Q9JLF6 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms