Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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SacsQ9JLC8 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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SacsQ9JLC8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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SacsQ9JLC8 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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SacsQ9JLC8 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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SacsQ9JLC8 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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SacsQ9JLC8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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SacsQ9JLC8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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SacsQ9JLC8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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SacsQ9JLC8 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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SacsQ9JLC8 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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SacsQ9JLC8 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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SacsQ9JLC8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SacsQ9JLC8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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