Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FancaQ9JL70 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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FancaQ9JL70 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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FancaQ9JL70 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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FancaQ9JL70 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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FancaQ9JL70 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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FancaQ9JL70 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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FancaQ9JL70 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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FancaQ9JL70 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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FancaQ9JL70 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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FancaQ9JL70 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FancaQ9JL70 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms