Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gfra4Q9JJT2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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