Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bap18Q9DCT6 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms