Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Syde1Q9DBZ9 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Syde1Q9DBZ9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Syde1Q9DBZ9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Syde1Q9DBZ9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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