Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rnf6Q9DBU5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf6Q9DBU5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf6Q9DBU5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf6Q9DBU5 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf6Q9DBU5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf6Q9DBU5 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf6Q9DBU5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf6Q9DBU5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Rnf6Q9DBU5 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rnf6Q9DBU5 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rnf6Q9DBU5 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rnf6Q9DBU5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rnf6Q9DBU5 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Rnf6Q9DBU5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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