Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrn2Q9DBR1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrn2Q9DBR1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms