Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SrpraQ9DBG7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms