Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf138rt1Q9D9M9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms