Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Alkbh4Q9D8F1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms