Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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