Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Srp19Q9D7A6 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms