Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc7Q9D541 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms