Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

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Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al3Q9D4U4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al3Q9D4U4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms