Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sgms2Q9D4B1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms