Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Cfap53Q9D439 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Cfap53Q9D439 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Cfap53Q9D439 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Cfap53Q9D439 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cfap53Q9D439 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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