Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Nlrp9b-202ENSMUST00000117909 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Gm11827-201ENSMUST00000142297 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Gm29601-201ENSMUST00000187961 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Gm28533-202ENSMUST00000190106 1346 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4cQ9D3F6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ms4a4cQ9D3F6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms