Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rufy3Q9D394 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rufy3Q9D394 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rufy3Q9D394 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rufy3Q9D394 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rufy3Q9D394 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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