Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms