Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms