Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ddx56Q9D0R4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms