Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mms19Q9D071 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms