Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Ssbp3Q9D032 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Ssbp3Q9D032 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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